Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PLIN4Q96Q06 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLIN4Q96Q06 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms