Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CAPZA3Q96KX2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPZA3Q96KX2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms