Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ABCC11Q96J66 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ABCC11Q96J66 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms