Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms