Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHDC4Q8TBB5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms