Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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ZNF548Q8NEK5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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ZNF548Q8NEK5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF548Q8NEK5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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