Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAS9

C5orf17, Uncharacterized protein C5orf17, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf17Q8NAS9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C5orf17Q8NAS9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms