Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLF2Q8IX21 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLF2Q8IX21 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms