Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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C9orf139Q6ZV77 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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C9orf139Q6ZV77 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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C9orf139Q6ZV77 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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C9orf139Q6ZV77 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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C9orf139Q6ZV77 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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C9orf139Q6ZV77 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C9orf139Q6ZV77 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf139Q6ZV77 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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