Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
APOA5Q6Q788 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOA5Q6Q788 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms