Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PRPF38BQ5VTL8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF38BQ5VTL8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms