Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HSD17B12Q53GQ0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms