Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC184Q52MB2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC184Q52MB2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms