Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRNQ4KMQ1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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