Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KNOP1Q1ED39 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KNOP1Q1ED39 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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