Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCK2Q16822 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCK2Q16822 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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