Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
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ECM1Q16610 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECM1Q16610 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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