Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASIC2Q16515 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASIC2Q16515 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ASIC2Q16515 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASIC2Q16515 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASIC2Q16515 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASIC2Q16515 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ASIC2Q16515 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASIC2Q16515 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASIC2Q16515 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASIC2Q16515 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ASIC2Q16515 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms