Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZFHX3Q15911 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZFHX3Q15911 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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