Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEDD8Q15843 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEDD8Q15843 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms