Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.947e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PKMYT1-220ENST00000576268 1091 ntTSL 319.91■□□□□ 0.787e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.757e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PKMYT1-218ENST00000575632 979 ntTSL 219.03■□□□□ 0.647e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 PKMYT1-214ENST00000574415 1006 ntTSL 518.94■□□□□ 0.627e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 TMEM164-206ENST00000464177 761 ntTSL 514.4□□□□□ -0.18e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.298e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.48e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.498e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.638e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 SQSTM1-215ENST00000514093 842 ntTSL 522.58■■□□□ 1.216e-7■■□□□ 13.3
PCBP1Q15365 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 217.23■□□□□ 0.351e-6■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 NUCB1-209ENST00000465524 839 ntTSL 517.56■□□□□ 0.46e-7■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 NUCB1-210ENST00000469291 582 ntTSL 215.41■□□□□ 0.066e-7■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 HLF-207ENST00000573422 493 ntTSL 412.59□□□□□ -0.396e-8■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 HLF-206ENST00000573020 414 ntTSL 48.74□□□□□ -1.016e-8■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 HLF-211ENST00000575868 558 ntTSL 45.64□□□□□ -1.516e-8■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.451e-7■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.692e-6■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.652e-6■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 HPN-204ENST00000593305 2175 ntTSL 220.17■□□□□ 0.826e-7■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 HPN-203ENST00000541345 1820 ntTSL 219.12■□□□□ 0.656e-7■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.828e-7■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 322.44■■□□□ 1.182e-6■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 PTTG1IP-205ENST00000474737 580 ntTSL 317.43■□□□□ 0.382e-6■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 513.65□□□□□ -0.222e-6■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 FGFR4-213ENST00000511076 838 ntTSL 521.62■■□□□ 1.052e-6■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 STAU1-208ENST00000437404 1085 ntTSL 1 (best)22.88■■□□□ 1.251e-17■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.491e-17■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.531e-17■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.671e-17■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.711e-17■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.711e-17■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-17■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.871e-17■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 PTBP1-207ENST00000585932 1030 ntTSL 323.08■■□□□ 1.292e-8■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 SEMA4C-203ENST00000449330 839 ntTSL 316.21■□□□□ 0.197e-7■■□□□ 13.2
PCBP1Q15365 STXBP2-213ENST00000599278 295 ntTSL 316.39■□□□□ 0.211e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PPIL2-207ENST00000462188 1735 ntTSL 217.83■□□□□ 0.445e-6■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PPIL2-205ENST00000446951 1926 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.215e-6■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.045e-6■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.065e-6■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.485e-6■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PPIL2-204ENST00000417788 4213 ntTSL 210.53□□□□□ -0.725e-6■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PPIL2-203ENST00000406385 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.825e-6■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.382e-6■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PSMF1-209ENST00000479715 660 ntTSL 314.7□□□□□ -0.062e-6■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.293e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PSMF1-203ENST00000335877 4290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.812e-6■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PSMF1-202ENST00000333082 3686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 AC104958.2-201ENST00000605955 1141 ntBASIC10.06□□□□□ -0.83e-6■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 C3-204ENST00000594936 625 ntTSL 217.66■□□□□ 0.423e-41■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 C3-213ENST00000600744 708 ntTSL 516.31■□□□□ 0.23e-41■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 TMC6-204ENST00000585849 552 ntTSL 221.34■■□□□ 1.011e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.591e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.421e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.311e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.141e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 AP2M1-222ENST00000621863 1305 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.565e-20■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 TTLL3-221ENST00000455274 2848 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.611e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.661e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.161e-8■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.754e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.134e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.034e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.064e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.14e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 SDC2-205ENST00000520233 563 ntTSL 419.58■□□□□ 0.722e-14■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 SDC2-203ENST00000519587 557 ntTSL 415.58■□□□□ 0.082e-14■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 SDC2-207ENST00000522911 677 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-14■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 RNH1-217ENST00000529768 1019 ntTSL 224.65■■□□□ 1.548e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 RNH1-210ENST00000525701 1794 ntTSL 522.69■■□□□ 1.228e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 222.66■■□□□ 1.228e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.178e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.148e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 FHOD1-202ENST00000561922 2069 ntTSL 222.16■■□□□ 1.148e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.138e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.18e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.038e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.99e-16■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.858e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 RNH1-207ENST00000524464 624 ntTSL 520.08■□□□□ 0.818e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.698e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.628e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.598e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 FHOD1-203ENST00000562266 486 ntTSL 218.47■□□□□ 0.558e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.348e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.319e-16■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 GRAMD1A-213ENST00000603669 552 ntTSL 516.9■□□□□ 0.38e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.178e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 FHOD1-207ENST00000567752 4321 ntTSL 215.48■□□□□ 0.078e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.059e-16■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.048e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.178e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.378e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 RNH1-209ENST00000525522 3281 ntTSL 1 (best)12.71□□□□□ -0.388e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 MGEA5-208ENST00000479811 695 ntTSL 512.12□□□□□ -0.479e-16■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 FHOD1-208ENST00000568595 520 ntTSL 412.01□□□□□ -0.498e-7■■□□□ 13.1
PCBP1Q15365 GRAMD1A-204ENST00000594597 567 ntTSL 411.55□□□□□ -0.568e-7■■□□□ 13.1
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