Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUBB3Q13509 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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