Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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