Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TP53BP1Q12888 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms