Protein–RNA interactions for Protein: Q11201

ST3GAL1, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL1Q11201 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ST3GAL1Q11201 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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