Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PUDPQ08623 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms