Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDE4BQ07343 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms