Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EGR3Q06889 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR3Q06889 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms