Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VLDLRP98155 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VLDLRP98155 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms