Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRB1P82279 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRB1P82279 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRB1P82279 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRB1P82279 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRB1P82279 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms