Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RPS28P62857 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms