Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTBP2P56545 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTBP2P56545 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms