Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PRKAA2P54646 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PRKAA2P54646 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms