Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI2P48788 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI2P48788 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms