Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGER2P43116 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms