Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACVR1BP36896 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACVR1BP36896 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms