Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DDIT3P35638 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDIT3P35638 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms