Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTSSP25774 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTSSP25774 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms