Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ATP5A1P25705 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATP5A1P25705 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms