Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK11BP21127 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms