Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD247P20963 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD247P20963 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD247P20963 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CD247P20963 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD247P20963 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms