Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB5AP20339 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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RAB5AP20339 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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RAB5AP20339 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB5AP20339 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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