Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTLA4P16410 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTLA4P16410 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms