Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CREB1P16220 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CREB1P16220 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CREB1P16220 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CREB1P16220 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CREB1P16220 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CREB1P16220 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CREB1P16220 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CREB1P16220 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CREB1P16220 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CREB1P16220 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CREB1P16220 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CREB1P16220 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CREB1P16220 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CREB1P16220 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CREB1P16220 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CREB1P16220 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CREB1P16220 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CREB1P16220 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CREB1P16220 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CREB1P16220 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CREB1P16220 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CREB1P16220 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms