Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH1P12882 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH1P12882 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH1P12882 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH1P12882 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH1P12882 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH1P12882 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH1P12882 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYH1P12882 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYH1P12882 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYH1P12882 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYH1P12882 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYH1P12882 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYH1P12882 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYH1P12882 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYH1P12882 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms