Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACTN1P12814 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACTN1P12814 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms