Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV1-8P0DP01 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV1-8P0DP01 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms