Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C6orf47O95873 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C6orf47O95873 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms