Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DENRO43583 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DENRO43583 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
DENRO43583 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DENRO43583 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DENRO43583 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DENRO43583 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DENRO43583 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DENRO43583 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms