Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ANKRD28O15084 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD28O15084 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms